معاونت درمان دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی فسا در راستای پوشش فراگیر دسترسی عادلانه آحاد جامعه به خدمات و مراقبت های با کیفیت سلامت، مأموریت برنامه ریزی، ساماندهی و هماهنگی فرایندهای ارائه خدمات درمانی در بخش دولتی و خصوصی در نظام سلامت شهرستان از طریق جذب و توزیع نیروی انسانی تخصصی، تجهیزات پزشکی و افزایش فضای فیزیکی بر اساس نیاز شهرستان با نظارت و ارزشیابی تمامی بیمارستان ها و مؤسسات تشخیصی، درمانی و همچنین حمایت و ایجاد زمینه های مشارکت بخش خصوصی در حوزه درمانی را با تأکید بر ارزش های اسلامی، اصول عدالت محوری، رازداری و حفظ کرامت انسانی بر عهده دارد و خود را در تحقق این اهداف متعهد می داند.